Pertanyaan

Standard Nucleotide BLAST tblastx BLASTN programs search nucleotide databases using a nucleotide query. more... Enter Query Sequence Enter accession number(s), gifs)or FASTA sequence(s)Clear Query subrange (?) square From square To square Or, upload file Pilih File Tidak ada file yang dipilih Job Title square Enter a descriptive title for your BLAST search ? square Align two or more sequences ? Choose Search Set Database Standard databases (nr etc.);rRNA/ITS databases ()Genomic + transcript databases Betacoronavirus Experimental databases Core nucleotide database (core nt) ? Organism Optional Enter organism name or id-completions will be suggested exclude square Enter organism common name binomial, or taxid Only 20 top taxa will be shown Models (XM/XP) U Uncultured/environmental sample sequences Sequences from type material square Youlike Create custom database Enter an Entrez query to limit search ? Program Selection Optimize for Highly similar sequences (megablast) More dissimilar sequences (discontiguus megablast) Somewhat similar sequences (blastn) Choose a BLAST algorithm (2) Search database core,nt using Megablast (Optimize for highly similar sequences) square Show results in a new window Algorithm parameters

Solusi

Terverifikasi Ahli
4.4 (230 Suara)
Bhavin elit ยท Tutor selama 8 tahun

Jawaban

Pertanyaan ini adalah tentang penggunaan program BLASTN untuk mencari database nukleotida menggunakan kueri nukleotida. Pengguna diminta untuk memasukkan urutan query, rentang subrange, mengunggah file, memberikan judul untuk pencarian BLAST, memilih set pencarian, memilih database, memasukkan nama organisme atau id, memasukkan nama umum organisme, memilih model, memasukkan urutan dari bahan tipe, membuat database kustom, memasukkan query Entrez untuk membatasi pencarian, memilih program, memilih algoritma BLAST, memilih database core, nt menggunakan Megablast, dan menampilkan hasil dalam jendela baru.

Penjelasan

BLASTN adalah program yang digunakan untuk mencari database nukleotida menggunakan kueri nukleotida. Pengguna dapat memasukkan urutan query, rentang subrange, mengunggah file, memberikan judul untuk pencarian BLAST, memilih set pencarian, memilih database, memasukkan nama organisme atau id, memasukkan nama umum organisme, memilih model, memasukkan urutan dari bahan tipe, membuat database kustom, memasukkan query Entrez untuk membatasi pencarian, memilih program, memilih algoritma BLAST, memilih database core, nt menggunakan Megablast, dan menampilkan hasil dalam jendela baru.